Tôi trích 1 đoạn trong thông tư 81/2006/TT-BTC để trả lời trong trường hợp này:
"Các đơn vị sự nghiệp thực hiện chế độ tự chủ phải mở tài khoản tại Kho bạc Nhà nước để thực hiện thu, chi qua Kho bạc Nhà nước đối với các khoản kinh phí thuộc ngân sách nhà nước theo quy định của Luật Ngân sách nhà nước (bao gồm kinh phí ngân sách nhà nước cấp, các khoản thu, chi theo quy định đối với nguồn thu từ phí và lệ phí thuộc ngân sách nhà nước và các khoản khác của ngân sách nhà nước nếu có); chịu sự kiểm tra, kiểm soát của Kho bạc Nhà nước trong quá trình tập trung và sử dụng các khoản kinh phí thuộc ngân sách nhà nước. "
Vì vậy:
---> Nguồn thu của đơn vị sự nghiệp sau khi nộp NSNN được để lại chi theo quy định thì có thể để trên TK ngân hàng để hoạt động và lãi NH xem như 1 nguồn thu khác của đơn vị, sẽ được cân nhắc để nộp thuế TNDN theo quy định
----> Nguồn thu của đơn vị sự nghiệp phải nộp vào NSNN nhưng để ở trên TK ngân hàng phát sinh lời sẽ phải nộp hết vào NSNN theo quy định