à, trường hợp này bạn phải làm thêm thủ các thủ tục quy định tại điều 24 thông tư 39 nha bạn:
Điều 24. Xử lý trong trường hợp mất, cháy, hỏng hóa đơn 1. Tổ chức, hộ, cá nhân kinh doanh nếu phát hiện mất, cháy, hỏng hóa đơn đã lập hoặc chưa lập phải lập báo cáo về việc mất, cháy, hỏng và thông báo với cơ quan thuế quản lý trực tiếp (mẫu số 3.8 Phụ lục 3 ban hành kèm theo Thông tư này) chậm nhất không quá năm (05) ngày kể từ ngày xảy ra việc mất, cháy, hỏng hóa đơn
[U1] . Trường hợp ngày cuối cùng (ngày thứ 05) trùng với ngày nghỉ theo quy định của pháp luật thì ngày cuối cùng của thời hạn được tính là ngày tiếp theo của ngày nghỉ đó.
2. Trường hợp khi bán hàng hóa, dịch vụ người bán đã lập hóa đơn theo đúng quy định nhưng sau đó người bán hoặc người mua làm mất, cháy, hỏng liên 2 hóa đơn bản gốc đã lập thì người bán và người mua lập biên bản ghi nhận sự việc, trong biên bản ghi rõ liên 1 của hóa đơn người bán hàng khai, nộp thuế trong tháng nào, ký và ghi rõ họ tên của người đại diện theo pháp luật (hoặc người được ủy quyền), đóng dấu (nếu có) trên biên bản và người bán sao chụp liên 1 của hóa đơn, ký xác nhận của người đại diện theo pháp luật và đóng dấu trên bản sao hóa đơn để giao cho người mua. Người mua được sử dụng hóa đơn bản sao có ký xác nhận, đóng dấu (nếu có) của người bán kèm theo biên bản về việc mất, cháy, hỏng liên 2 hóa đơn để làm chứng từ kế toán và kê khai thuế. Người bán và người mua phải chịu trách nhiệm về tính chính xác của việc mất, cháy, hỏng hóa đơn
[U1]Thời điểm 5 ngày là tính từ lúc phát hiện ra hóa đơn bị mất, không phải ngày ghi trên hóa đơn. Khi làm công văn giải trình việc mất hóa đơn kế toán phải khéo một chút . ví dụ hóa đơn ghi ngày 20/02/2012 bị mất lâu rồi nhưng đến giờ mới phát hiện ra. thì kế toán giải trình là trong lúc tìm kiếm hồ sơ giao hàng, bàn giao hồ sơ với kế toán mới thì phát hiện mất ngày 10/05/2012 mang lên thuế nộp tầm ngày 12,13/ 05 vậy là vẫn đúng quy định và chỉ bị phạt vài trăm là cùng. phát hiện mất cả tháng rồi mới báo cũng làm như trên, bên thuế không thể kiểm tra được phát hiện mất lúc nào. 
