Tại Nghị định số 65/2013/NĐ-CP ngày 27/6/2013 của Chính phủ có hiệu lực từ ngày 01/07/2013 quy định về khai thuế, nộp thuế, quyết toán thuế thu nhập cá nhân (TNCN):
Khai thuế, nộp thuế theo tháng áp dụng đối với tổ chức, cá nhân trả thu nhập có thực hiện khấu trừ thuế đối với các khoản thu nhập quy định mà số thuế TNCN đã khấu trừ hàng tháng của mỗi loại tờ khai có từ 50 triệu đồng trở lên, trừ trường hợp là đối tượng khai, nộp thuế giá trị gia tăng theo quý.
Khai thuế, nộp thuế theo quý áp dụng đối với tổ chức, cá nhân trả thu nhập có thực hiện khấu trừ thuế đối với các khoản thu nhập quy định nhưng không thuộc diện khai thuế, nộp thuế theo tháng có nghĩa là số thuế TNCN đã khấu trừ của mỗi loại loại tờ khai dưới 50 triệu đồng.
Theo công văn số 8355/BTC-TCT ngày 28/6/2013 của Bộ Tài chính:
Từ tháng 7/2013 tổ chức, cá nhân chi trả thu nhập khai thuế GTGT theo quý thì cũng thực hiện khai thuế TNCN theo quý, kể cả trường hợp đã xác định hình thức khai thuế TNCN theo tháng từ đầu năm 2013; kể cả trong 06 tháng cuối năm 2013 có phát sinh khấu trừ thuế TNCN của một loại tờ khai bất kỳ trên 50 triệu đồng. Có nghĩa là khai thuế TNCN theo kê khai thuế GTGT.
Từ tháng 7/2013 tổ chức, cá nhân chi trả thu nhập được xác định thuộc diện khai thuế GTGT theo tháng, đồng thời trước 01/7/2013 tổ chức, cá nhân đã xác định thuộc diện khai thuế TNCN theo tháng. Tháng 7/2013 phát sinh khấu trừ thuế TNCN tại tờ khai (VD: tờ khai số 02/KK-TNCN nhỏ hơn 50 triệu) và tờ khai số 03/KK-TNCN là 50 triệu đồng) thì tổ chức, cá nhân chi trả thu nhập tiếp tục kê khai thuế TNCN theo tháng cho 06 tháng cuối năm 2013.
Từ tháng 7/2013 tổ chức, cá nhân chi trả thu nhập được xác định thuộc diện khai thuế GTGT theo tháng, đồng thời trước 01/7/2013 tổ chức, cá nhân đã xác định thuộc diện khai thuế TNCN theo tháng. Tháng 7/2013 phát sinh khấu trừ thuế TNCN tại tờ khai (VD: tờ khai số 02/KK-TNCN và tờ khai số 03/KK-TNCN nhỏ hơn 50 triệu đồng) thì tổ chức, cá nhân chi trả thu nhập điều chỉnh lại hình thức kê khai thuế TNCN theo quý cho 06 tháng cuối năm 2013.
Khai thuế, nộp thuế theo tháng áp dụng đối với tổ chức, cá nhân trả thu nhập có thực hiện khấu trừ thuế đối với các khoản thu nhập quy định mà số thuế TNCN đã khấu trừ hàng tháng của mỗi loại tờ khai có từ 50 triệu đồng trở lên, trừ trường hợp là đối tượng khai, nộp thuế giá trị gia tăng theo quý.
Khai thuế, nộp thuế theo quý áp dụng đối với tổ chức, cá nhân trả thu nhập có thực hiện khấu trừ thuế đối với các khoản thu nhập quy định nhưng không thuộc diện khai thuế, nộp thuế theo tháng có nghĩa là số thuế TNCN đã khấu trừ của mỗi loại loại tờ khai dưới 50 triệu đồng.
Theo công văn số 8355/BTC-TCT ngày 28/6/2013 của Bộ Tài chính:
Từ tháng 7/2013 tổ chức, cá nhân chi trả thu nhập khai thuế GTGT theo quý thì cũng thực hiện khai thuế TNCN theo quý, kể cả trường hợp đã xác định hình thức khai thuế TNCN theo tháng từ đầu năm 2013; kể cả trong 06 tháng cuối năm 2013 có phát sinh khấu trừ thuế TNCN của một loại tờ khai bất kỳ trên 50 triệu đồng. Có nghĩa là khai thuế TNCN theo kê khai thuế GTGT.
Từ tháng 7/2013 tổ chức, cá nhân chi trả thu nhập được xác định thuộc diện khai thuế GTGT theo tháng, đồng thời trước 01/7/2013 tổ chức, cá nhân đã xác định thuộc diện khai thuế TNCN theo tháng. Tháng 7/2013 phát sinh khấu trừ thuế TNCN tại tờ khai (VD: tờ khai số 02/KK-TNCN nhỏ hơn 50 triệu) và tờ khai số 03/KK-TNCN là 50 triệu đồng) thì tổ chức, cá nhân chi trả thu nhập tiếp tục kê khai thuế TNCN theo tháng cho 06 tháng cuối năm 2013.
Từ tháng 7/2013 tổ chức, cá nhân chi trả thu nhập được xác định thuộc diện khai thuế GTGT theo tháng, đồng thời trước 01/7/2013 tổ chức, cá nhân đã xác định thuộc diện khai thuế TNCN theo tháng. Tháng 7/2013 phát sinh khấu trừ thuế TNCN tại tờ khai (VD: tờ khai số 02/KK-TNCN và tờ khai số 03/KK-TNCN nhỏ hơn 50 triệu đồng) thì tổ chức, cá nhân chi trả thu nhập điều chỉnh lại hình thức kê khai thuế TNCN theo quý cho 06 tháng cuối năm 2013.