Theo Thông tư 120/2003/TT-BTC ngày 12/12/2003 và hướng dẫn trên website của Tổng cục thuế đã đề cập tới Biên bản điều chỉnh hóa đơn khi hóa đơn bị sai về mặt con số (số lượng, đơn giá, thuế suất) so với hàng xuất thực tế. Dựa vào Biên bản điều chỉnh này, đồng thời cũng phải xuất Hóa đơn điều chỉnh ra. Như vậy, cùng một lúc phải lập Biên bản và Hóa đơn điều chỉnh, chỉ có Biên bản điều chỉnh thì chưa đủ.
Những trường hợp sai khác trên hóa đơn, mình chưa thấy có văn bản hướng dẫn sử dụng Biên bản điều chỉnh hóa đơn để sửa sai. Cách duy nhất là hủy hóa đơn đó đi, lập Biên bản hủy hóa đơn và xuất Hóa đơn mới ra thay thế.
Theo Luật kế toán, chứng từ kế toán không được phép tẩy xóa, sửa chữa. Do đó, việc sửa lại và đóng dấu đè lên trên Hóa đơn cũng không được chấp nhận.