Chi nhánh hạch toán phụ thuộc: nghĩa vụ về thuế GTGT sẽ độc lập giữa chi nhánh và công ty mẹ. Còn lại, nghĩa vụ các loại thuế khác sẽ thuộc công ty mẹ. Nói gọn lại một chút: thuế GTGT sẽ do chi nhánh kê khai và nộp, doanh thu và chi phí sẽ đưa về công ty mẹ để công ty mẹ hạch toán và tính lợi nhuận, thuế TNDN phải nộp.
Chi nhánh hạch toán độc lập: mọi nghĩa vụ về thuế sẽ độc lập giữa chi nhánh và công ty mẹ. Do đó, kê khai thuế, nộp thuế, doanh thu, chi phí, lợi nhuận sẽ thuộc về chi nhánh.