Bù trừ Thuế GTGT đầu ra cho các công trình thi công tại Hà Nội

[Nguyet.moon]

Công ty mình đang có một số vướng mắc về thuế vãng lai như sau, mình muốn đăng lên để các công ty bạn có cùng trường hợp thì trao đổi kinh nghiệm nhé.
Công ty mình có làm một số công trình ở Hà Nội bằng vốn Ngân sách, khi kho bạc chuyển tiền thanh toán khối lượng thì thu luôn 1% thuế vãng lai.
Thông thường công ty mình thi công các công trình tại các tỉnh mình vẫn nộp vãng lai như vậy và sau đó về Cục thuế HN mình sẽ kê khai bù trừ với thuế GTGT ĐR tại HN, tuy nhiên với trường hợp nộp vãng lai tại Hà Nội cho các công trình thi công tại Hà Nội lại không có hướng dẫn bù trừ, nên mình vẫn phải kê và nộp thuế ĐR bình thường cho các công trình có phát sinh thuế, như vậy là khoản vãng lai mình đang bị nộp thừa. Mình muốn hỏi có bạn nào bị trường hợp như vậy cho mình xin hướng giải quyết. Mình xin cảm ơn cả nhà.