Theo hướng dẫn của Công văn 3736/CT-TTHT ngày 29.04.2011 của Cục thuế Tp. HCM:
Trường hợp Công ty (là đơn vị bán hàng) đã lập hóa đơn nhưng trong quá trình giao dịch giữa 2 bên liên 2 (gốc) bị mất thì tiến hành thực hiện hồ sơ theo điều 22 Thông tư 153/2010/TT-BTC:
Nếu người bán làm mất: lập báo cáo về việc mất hóa đơn gửi Chi cục thuế quản lý trực tiếp trong vòng 5 ngày kể từ ngày xảy ra sự việc mất. Bên bán sẽ bị phạt hành chính 3,5tr (điều 12 - NĐ 185/2004/NĐ-CP ngày 4/11/2004 của Chính phủ).
Nếu quá thời hạn 5 ngày mà không báo cáo thì bị phạt 15tr (điều 33 Nghị định 51/2010/NĐ-CP).
Nếu người mua làm mất: người mua lập báo cáo cho Chi cục thuế quản lý trực tiếp, thời hạn cũng là 5 ngày => người mua bị phạt 3tr (theo điều 34 Nghị định 51/2010/NĐ-CP). Nếu quá 5 ngày mà không nộp báo cáo thì bị phạt 15tr (điều 33 Nghị định 51/2010/NĐ-CP)
Mất hóa đơn nhưng bạn vẫn phải khai báo doanh thu và Thuế, trên báo cáo tình hình sử dụng hóa đơn quý 3, ghi số hóa đơn bị mất vào cột Mất