Bạn làm theo hướng dẫn tại thông tư 130/2008/TT-BTC hướng dẫn thi hành một số điều của Luật thuế TNDN: Tớ xin trích dẫn, và nếu có thuế GTGT thì được khấu trừ rồi:
"2.9. Chi phụ cấp tàu xe đi nghỉ phép không đúng theo quy định của Bộ Luật Lao động; Phần chi phụ cấp cho người lao động đi công tác trong nước và nước ngoài (không bao gồm tiền đi lại và tiền ở) vượt quá 2 lần mức quy định theo hướng dẫn của Bộ Tài chính đối với cán bộ công chức, viên chức Nhà nước."