Trường hợp mua hàng thanh toán nhiều lần thì phần giá trị được thanh toán bằng chuyển khoản đúng quy định vẫn được khấu trừ.
Ngoài ra, CV 10220 có nói rằng: "Đối với trường hợp hàng hoá, dịch vụ mua vào có giá trị từ 20 triệu đồng trở lên trong thời gian từ ngày 01/01/2009 đến hết ngày 31/03/2009 có chứng từ chứng minh việc nộp tiền mặt vào tài khoản bên bán hoặc có chứng từ chuyển tiền vào tài khoản bên bán được kê khai, khấu trừ thuế GTGT đầu vào".
Như vậy, không phải trước 31/3 là thanh toán bằng cách nào cũng được khấu trừ mà Bộ Tài chính chỉ mở rộng cho các trường hợp nộp tiền mặt vào tài khoản bên bán mà thôi.