Tổng cục Thuế trả lời nguyên tắc như sau:
Căn cứ quy định tại điểm 1, 2 và 3 Mục II, Phần D Thông tư số 128/2003/TT-BTC ngày 22/12/2003 của Bộ Tài chính hướng dẫn thi hành Nghị định số 164/2003/NĐ-CP ngày 22/12/2003 của Chính phủ quy định chi tiết thi hành Luật thuê TNDN thì: Cơ sở kinh doanh có trách nhiệm kê khai và nộp tờ khai thuế thu nhập doanh nghiệp cho cơ quan thuế trực tiếp quản lý; căn cứ để kê khai là dựa vào kết quả sản xuất kinh doanh hàng hoá, dịch vụ của năm trước và khả năng kinh doanh của năm tiếp theo; nếu kết quả sản xuất kinh doanh 6 tháng đầu năm có thay đổi lớn tăng hoặc giảm 20% số thuế đã kê khai tạm nộp, cơ sở kinh doanh phải khai báo điều chỉnh số thuế tạm nộp cả năm và hai quý cuối năm. Cơ quan thuế có trách nhiệm kiểm tra, xem xét việc kê khai thuế của cơ sở kinh doanh, cơ sở kinh doanh không kê khai hoặc kê khai không rõ các căn cứ để xác định số thuế tạm nộp thì cơ quan thuế yêu cầu cơ sở kinh doanh giải trình các căn cứ để xác định số thuế tạm nộp cả năm. Trường hợp cơ sở kinh doanh không giải trình hoặc không chứng minh được căn cứ ghi trong tờ khai thì cơ quan thuế căn cứ vào doanh thu của năm dự toán và tỷ lệ thu nhập chịu thuế trên doanh thu của năm trước, thu nhập chịu thuế của cơ sở kinh doanh có cùng ngành nghề, quy mô kinh doanh tương đương để ấn định thu nhập chịu thuế cả năm, số thuế TNDN tạm nộp cả năm, từng quý thông báo cho cơ sở kinh doanh thực hiện.