Nếu bỏ qua chuyện khai thuế mà chỉ xét về chuyện hạch toán và thể hiện sổ sách thì âm thuế GTGT là chuyện bình thường chứ có vấn đề gì đâu. Âm thuế đầu ra thuế GTGT không có nghĩa là hạch toán sai.
Quy định chính sách là nếu VAT input (Đầu vào)> VAT output (Đầu ra) thì kết chuyển toàn bộ còn nếu VAT input<VAT output thì kết chuyển số bằng số dư VAT output còn lại theo dõi trên VAT input. Thực ra cái quy định này quá là lỗi thời, xây dựng cho kế toán thủ công là chính ( Cứng nhắc).
Thực tế có nhiều công ty căn cứ các quy định hiện hành gửi công văn cho BTC và họ chỉ theo dõi thuế GTGT trên 1 tài khoản VAT output vào cuối kỳ. Nếu dương thể hiện là số thuế còn phải nộp, nếu âm thì sẽ khấu trừ tiếp kỳ sau, cuối kỳ kết chuyển toàn bộ VAT đầu vào sang TK này mà không treo. thực sự cách làm này thì TK VAT đầu vào chỉ được coi là TK trung gian như là các tài khoản chi phí cuối kỳ phải tất toán số dư = 0. Cách làm này khoa học hơn, đỡ thời gian hơn rất nhiều và thao tác rất đơn giản, hoàn toàn tuân theo âm dương.
Về mặt ngôn từ, từ ngữ âm thuế là câu nói rất phổ biến. Chính sách không cấm bạn nhưng nếu bạn thực hiện khoa học và không vi phạm pháp luật, bạn phải đăng ký, dĩ nhiên là bạn sẽ được chấp thuận.
Đối với thuế TNDN bạn cần để ý một chút về mặt chính sách. Với thuế TNDN, nhà nước không nợ doanh nghiệp, còn thuế GTGT thì nhà nước có thể trả lại bạn, có nghĩa là nó có thể được phản ánh là một khoản phải thu. Những vấn đề này có ảnh hưởng rất nhiều về mặt bản chất trong hạch toán sổ sách.